Aminotransferases compartilham certos mecanismos com outras enzimas dependentes de pyridoxal-P, como a ligação covalente ao grupo Pridoxal-phosphate a um resíduo de lysine. Baseado na seqüência de amino acids, estas enzimas podem ser agrupadas em subfamílias.

--Class I:
Atualmente constitui-se das seguintes enzimas: aspartate aminotransferase (AAT) (EC 2.6.1.1), tyrosine aminotransferase (EC 2.6.1.5), aromáticos aminotransferase (EC 2.6.1.57), 1-aminociclopropano-1-carboxylato sintase (EC 4.4.1.14), e outras proteínas. A seqüência ao redor do sítio de ligação do pyridoxal-P nesta Class de enzimas é suficientemente conservada para mermitir a criação de uma assinatura para reconhecimento.
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--Class II:
Atualmente constitui-se das seguintes enzimas: glycine acetyltransferase (EC 2.3.1.29), ácido 5-aminolevulínico (EC 2.3.1.37), (EC 2.3.1.47), Histidinol-P aminotransferase(EC 2.6.1.9), serine palmitoyl-transferase (EC 2.3.1.50). A seqüência ao redor do sítio de ligação do pyridoxal-P nesta Class de enzimas é suficientemente conservada para mermitir a criação de uma assinatura para reconhecimento.
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--Class III:
Atualmente constitui-se das seguintes enzimas: acetylornithine aminotransferase (EC 2.6.1.11), ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13), w-amino-ácido-pyruvate aminotransferase (EC 2.6.1.18), 4-aminobutirato amniotransferase (EC 2.6.1.19), DAPA aminotrasnferase (EC 2.6.1.62), 2,2-dialquilglycine descarboxylase (EC 4.1.1.64), glutamate-1-semialdehyde aminotransferase (EC 5.4.3.8), e outras proteínas. A seqüência ao redor do sítio de ligação do pyridoxal-P nesta Class de enzimas é suficientemente conservada para mermitir a criação de uma assinatura para reconhecimento.
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--Class IV:
Atualmente constitui-se das seguintes enzimas: amino acids de cadeia ramificada aminotransferase (EC 2.6.1.42), D-alanine aminotransferase (EC 2.6.1.21), 4-amino-4-deoxicorismato liase. Estas são enzimas de cerca de 270 a 415 resíduos de amino acids que compartilham algumas regiões de similaridade na seqüência. Supreendentemente, a mais conservada delas não inclui o resíduo de lysine ao qual o pyridoxal-P se liga. Esta região é utilizada como assinatura de reconhecimento e está localizada a 40 resíduos da lysine ativa, pelo seu lado C-terminal.
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--Class V :
Atualmente constitui-se das seguintes enzimas: phosphoserine aminotransferase (EC 2.6.1.52), serine-glioxalato aminotransferase (EC 2.6.1.45), serine-pyruvate aminotransferase (EC 2.6.1.51), e outras proteínas. A seqüência ao redor do sítio de ligação do pyridoxal-P nesta Class de enzimas é suficientemente conservada para mermitir a criação de uma assinatura para reconhecimento.
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